fsl을 공부하기 위한 resource들 - 홈페이지 편

이번에는 fsl을 공부하기 위한 여러가지 resource들을 정리하여 보겠습니다. 일단 fsl은 FMRIB software library의 약자로, Stephen Smith와 동료들에 의하여 Oxford University에서 만들어진 것입니다.

1. FMRIB의 홈페이지(http://www.fmrib.ox.ac.uk/)이기도 합니다. 여기에서 fmrib의 감을 잡을 수 있습니다.

2. FSL의 홈페이지는 http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/ 입니다. 여기에서는 본격적으로 fsl에 대한 내용들을 다룹니다.

fmrib의 홈페이지에서 우측 상단에 조그맣게 쓰인 FSL을 클릭하면 여기로 연결 됩니다.

들어가보시면 이제 fsl의 버전은 현재 Release 5.0, September 2012이 최신 버전임을 알 수 있습니다.

여기에서 추가적으로 나오는 이름이 freesurfer입니다. freesurfer는 이전의 글에서 fMRI용 소프트웨어 패키지에 이름이 나오지 않았는데, 원래 anatomical MRI analysis를 위해서 개발된 소프트웨어이기 때문에 그렇습니다. 그렇지만 해부학적으로는 cortical surface model과 anatomical parcellation을 만들어 낼 수 있어서 volume-based method보다는 surface-based approach를 하는 것이 좀 더 유용한 경우에 data들의 align을 위해서 사용할 수 있기 때문에 유용합니다. FSL을 사용하여 얻은 statistical result들을 reconstructed cortical surface에 project하여서 surface-based group statistical analysis를 할 수 있게 합니다.

그래서 freesurfer는 Bruce Fischl등에 의하여서 MGH에서 개발되어서 FSL과는 개발자가 다름에도 불구하고 함께 묶어서 워크샵을 하는 경우가 많습니다.

FSL 홈페이지로 들어 가시면 다음과 같이 연결됩니다.

이 중에서 진짜 백미는 빨간 박스를 친 support 항목이라고 생각됩니다. 여기로 들어가시면 많은 정보의 바다를 만나시게 됩니다.