MRI neuroimaging에서의 기본 사항 - space

neuroimaging을 하다 보면 헷갈릴 수 있는 것이 바로 space에 대한 설명들입니다.

Talairach space (가장 기본이 됨. Proportional grid system)

 From atlas of Talairach and Tournoux (T&T, 1988)

Based on single subject (60 years, female, Cadaver) - 1개인의 부검뇌에 의존

Single hemisphere

First commonly used system

 uses a right-handed system
 소뇌와 뇌간부가 빠짐
 Brodmann 영역의 특정에 관해서는 Talairach space가 우수함

객관적으로 전뇌영역을 검색하기 위해 형태가 다른 각 개인의 뇌기능정보를 Talairach and Tournoux의 표준뇌에 맞도록 변형함으로써 뇌형태의 개인차를 없이하고 화상통계해석을 하는 방법이 연구면뿐만 아니라 임상현장에서도 이용되고 있습니다.

--------------------------------------------------------------------------------

Montreal Neurological Institues (MNI) space

 The MNI template follows the convention of T&T, but doesn’t match the particular brain.

 Combination of many MRI scans on normal controls - 다수의 정상 뇌에 근거함

 All right-handed subjects

 Taller from AC by 5mm, deeper from AC by 10mm
 소뇌와 뇌간부를 포함함


보통 통계해석결과는 X, Y, Z의 좌표와 t값 및 t값을 표준 정규분포에 따르도록 변환한 Z값으로 표시됩니다.

여기서 보통 주어지는 좌표는 MNI에서 개발한 표준뇌가 이용되고 있습니다. (하지만, 이 좌표를 다시 Talairach의 좌표로 변환함으로써 Brodmann 분류에 의한 피질영역을 특정할 수가 있게 됩니다. 이 좌표 변환방법에도 다양한 방법들이 있습니다. meta-analysis를 할 때에 GingerALE이라는 프로그램에서는 대표적으로 Lancaster transformation을 사용해서 MNI에서 Talairach 좌표계로 바꾸어서 사용합니다.)


 Used by FSL, SPM (기본적으로 제공하는 template), fMRI Data center, International Consortium for Brain Mapping, many others

fsl에는 152명의 뇌에서 얻은 MNI152 space가 들어 있습니다.

이 space들에 올려져 있는 뇌의 다양한 atlas들이 있습니다.

fsl에서 사용하는 보다 더 자세한 template과 atlas에 대한 설명은 http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/Atlases?highlight=%28%28Atlases%29%29 에서 찾아 볼 수 있습니다.